中心依托单位为南京大学和中国·金沙集团1862成色科技有限公司-企业百科，2009年通过国家科技部组织的专家评审，正式批准组建(国科发计[2009]605号)，并于2013年11月以优异的成绩通过国家科技部组织的验收。
中心瞄准国家重大需求以及工程技术学科国际发展前沿，以毒害有机污染物控制为导向，创新性地开展技术与工程装备研发、成果转化与产业化，发展新型战略环保产业，推动我国传统化工等行业转型升级，努力成为国际一流的毒害有机污染物控制与资源化工程技术创新研究平台，国际合作与技术交流中心和高层次创新人才培养基地。